Amidaza (AMD)
Fermentlər:Makromolekulyar bioloji katalizatorlardır, əksər fermentlər zülallardır
Amidaza:Sərbəst turşular və ammonyak istehsalı ilə bir asil qrupunu suya köçürməklə müxtəlif endogen və xarici alifatik və aromatik amidlərin hidrolizini katalizləyin.Hidroksamik turşular və digər üzvi turşular böyümə faktorlarının, antibiotiklərin və şiş inhibitorlarının tərkib hissəsi olduqları üçün dərman kimi geniş istifadə olunur.Amidazalar katalizatorun stereoselektivliyinə görə R tipli və S tipli asilazlara bölünə bilər.
Amidlərin hidrolizini kataliz etməklə yanaşı, amidaz hidroksilamin kimi ko-substratların iştirakı ilə asil transfer reaksiyalarını da kataliz edə bilər.
Müxtəlif mənbələrə malik olan amidazalar müxtəlif substrat spesifikliyinə malikdirlər, onlardan bəziləri yalnız aromatik amidləri, bəziləri yalnız alifatik amidləri, bəziləri isə α- və ya ω-aminoamidləri hidroliz edə bilir.Aminlərin əksəriyyəti yalnız asiklik və ya sadə aromatik amidlər üçün yaxşı katalitik aktivliyə malikdir, lakin mürəkkəb aromatiklər üçün heterosiklik amidlər, xüsusən də ortoəvəzediciləri olan amidlər ümumiyyətlə aşağı aktivliyə malikdirlər (yalnız bir neçə ferment daha yaxşı katalitik təsir göstərir).
Katalitik mexanizm:
| Fermentlər | Məhsul Kodu | Məhsul Kodu |
| Ferment tozu | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 amidaza dəsti, hər biri 50 mq 19 maddə * 50 mq / maddə və ya digər miqdar |
| Skrininq Dəsti (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 amidaz dəsti, hər biri 1 mq 19 maddə * 1 mq / maddə |
★ Yüksək substrat spesifikliyi.
★ Güclü şiral seçicilik.
★ Yüksək dönüşüm səmərəliliyi.
★ az yan məhsullar.
★ Yüngül reaksiya şəraiti.
★ Ekoloji cəhətdən təmiz.
➢ Substratın spesifikliyinə görə xüsusi substratlar üçün ferment skrininqi aparılmalı və hədəf substratı ən yaxşı katalitik effektlə kataliz edən ferment əldə edilməlidir.
➢ Heç vaxt yüksək temperatur, yüksək/aşağı pH və yüksək konsentrasiyalı üzvi həlledici kimi ekstremal şəraitlərlə təmasda olmayın.
➢ Normalda reaksiya sisteminə substrat, bufer məhlulu (fermentin optimal reaksiya pH-ı) daxil olmalıdır.Hidroksilamin kimi ko-substratlar asil transfer reaksiya sistemində olmalıdır.
➢ AMD optimal reaksiya pH və temperaturu olan reaksiya sisteminə ən son əlavə edilməlidir.
➢ AMD-nin bütün növləri müxtəlif optimal reaksiya şərtlərinə malikdir, ona görə də onların hər biri ayrı-ayrılıqda tədqiq edilməlidir.
Misal 1(1):
Müxtəlif Amid Substratlara hidroliz fəaliyyəti
| Substrat | Xüsusi fəaliyyət μmol min-1mg-1 | Substrat | Xüsusi fəaliyyət μmol min-1mg-1 |
| Asetamid | 3.8 | ο- OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p- OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butiramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0.8 |
| İzobutiramid | 26.2 | ο-Toluamid | 0.3 |
| Pentanamid | 22.0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Heksanamid | 6.4 | Nikotinamid | 1.7 |
| Sikloheksamid | 19.5 | İzonicotinamid | 1.8 |
| Akrilamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrilamid | 3.5 | 3-fenilpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | İndol-3-asetamid | 1.9 |
| Benzamid | 6.8 |
Reaksiya 50 mM natrium fosfat tampon məhlulunda, pH 7,5, 70 ℃ temperaturda aparılmışdır.
| Amidlər | Hidroksilamin | Hidrazin |
| Asetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18.4 | 3.0 |
| İzobutiramid | 25.0 | 22.7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reaksiya 50 mM natrium fosfat tampon məhlulunda, pH 7,5, 70 ℃ temperaturda aparılmışdır.
Əlaqədar reagent konsentrasiyası: amidlər, 100 mM(benzamid, 10 mM);hidroksilamin və hidrazin, 400 mM;ferment 0,9 μM.
Misal 2(2):
Misal 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Ekstremofillər, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR və s.Proses Biokimyası, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al.Bioorganic Chemistry, 2017, Onlayn mövcuddur 7.
