Amidaza (AMD)
Fermentlər:Makromolekulyar bioloji katalizatorlardır, əksər fermentlər zülallardır
Amidaza:Sərbəst turşular və ammonyak istehsal edərək asil qrupunu suya köçürərək müxtəlif endogen və xarici alifatik və aromatik amidlərin hidrolizini katalizləşdirin. Hidroksamik turşular və digər üzvi turşular böyümə faktorlarının, antibiotiklərin və şiş inhibitorlarının tərkib hissələri olduqları üçün dərman kimi geniş istifadə olunur. Amidazalar katalizatorun stereoselektivliyinə görə R tipli və S tipli asilazalara bölünə bilər.
Amidlərin hidrolizini katalizləşdirməklə yanaşı, amidaza hidroksilamin kimi birgə substratların iştirakı ilə asil transfer reaksiyalarını da katalizləşdirə bilər.
Müxtəlif mənbələrdən olan amidaz fərqli substrat spesifikliyinə malikdir, bəziləri yalnız aromatik amidləri, bəziləri isə yalnız alifatik amidləri, bəziləri isə α- və ya ω-amino amidləri hidrolizə edə bilər. Aminlərin əksəriyyəti yalnız asiklik və ya sadə aromatik amidlər üçün yaxşı katalitik aktivliyə malikdir, lakin mürəkkəb aromatiklər üçün heterosiklik amidlər, xüsusən də orto əvəzediciləri olan amidlər ümumiyyətlə aşağı aktivliyə malikdir (yalnız bir neçə ferment daha yaxşı katalitik təsir göstərir).
Katalitik mexanizm:
| Fermentlər | Məhsul Kodu | Məhsul Kodu |
| Ferment tozu | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 amidaza dəsti, hər biri 50 mq, 19 məhsul * 50 mq / məhsul və ya digər miqdar |
| Sınaq Dəsti (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 amidaza dəsti, hər biri 1 mq, 19 məhsul * 1 mq / məhsul |
★ Yüksək substrat spesifikliyi.
★ Güclü kiral selektivlik.
★ Yüksək konversiya səmərəliliyi.
★ Daha az yan məhsul.
★ Yüngül reaksiya şəraiti.
★ Ətraf mühitə uyğun.
➢ Substratın spesifikliyinə görə spesifik substratlar üçün ferment skrininqi aparılmalı və hədəf substratı ən yaxşı katalitik təsirlə katalizləşdirən bir ferment əldə edilməlidir.
➢ Yüksək temperatur, yüksək/aşağı pH və yüksək konsentrasiyalı üzvi həlledici kimi ekstremal şəraitlərlə heç vaxt təmasda olmayın.
➢ Normalda reaksiya sisteminə substrat, bufer məhlulu (fermentin optimal reaksiya pH dəyəri) daxil olmalıdır. Asil transfer reaksiya sistemində hidroksilamin kimi birgə substratlar mövcud olmalıdır.
➢ AMD optimal reaksiya pH və temperaturu olan reaksiya sisteminə sonuncu dəfə əlavə edilməlidir.
➢ Bütün AMD növləri müxtəlif optimal reaksiya şərtlərinə malikdir, buna görə də onların hər biri ayrıca öyrənilməlidir.
Nümunə 1(1):
Müxtəlif Amid Substratlarına Hidroliz Aktivliyi
| Substrat | Xüsusi fəaliyyət μmols dəq-1mg-1 | Substrat | Xüsusi fəaliyyət μmols dəq-1mg-1 |
| Asetamid | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butyramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0.8 |
| İzobutiramid | 26.2 | ο-Toluamid | 0.3 |
| Pentanamid | 22.0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Heksanamid | 6.4 | Nikotinamid | 1.7 |
| Sikloheksanamid | 19.5 | İzonikotinamid | 1.8 |
| Akrilamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrilamid | 3.5 | 3-Fenilpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | İndol-3-asetamid | 1.9 |
| Benzamid | 6.8 |
Reaksiya 70°C-də pH 7.5 olan 50 mM natrium fosfat bufer məhlulunda aparılmışdır.
| Amidlər | Hidroksilamin | Hidrazin |
| Asetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18.4 | 3.0 |
| İzobutiramid | 25.0 | 22.7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reaksiya 70°C-də pH 7.5 olan 50 mM natrium fosfat bufer məhlulunda aparılmışdır.
Əlaqəli reagent konsentrasiyası: amidlər, 100 mM (benzamid, 10 mM); hidroksilamin və hidrazin, 400 mM; ferment 0.9 μM.
Nümunə 2(2):
Nümunə 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Ekstremofillər, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR və b. Proses Biokimyası, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM və b. Bioüzvi Kimya, 2017, Onlayn mövcuddur 7.
